İçerik: Bu eğitimde, FSL ve CONN yazılımları kullanılarak difüzyon ağırlıklı manyetik rezonans görüntüleme (MRG) verisinde yapısal bağlantısallık ve dinlenim durumu fonksiyonel MRG verisinde fonksiyonel bağlantısallık analizleri kapsamlı bir şekilde ele alınacaktır. Kursta öncelikle entrensek bağlantısallık ağları teorik zeminde ve yapısal bağlantılar çerçevesinde ele alınacak, daha sonra ağ işlevlerine ilişkin kognitif bir perspektif sunulacaktır. Kursun ikinci oturumunda fonksiyonel ve yapısal bağlantısallık temelli MRG analizleri için teorik bilgiler anlatılacaktır. Kursun üçüncü oturumunda, yapısal bağlantısallık analizlerinin pratik uygulamalarına odaklanılacaktır. Bu kapsamda, FSL yazılımı kullanılarak difüzyon ağırlıklı MRG verisi üzerinde önişleme adımları gerçekleştirilecek; ardından tensör metrikleri elde edilerek, bu veriler üzerinde yolak temelli uzamsal istatistik (Tract-Based Spatial Statistics - TBSS) analizi uygulamalı olarak gösterilecektir. Kursun son oturumunda, dinlenim durumu fMRG verisi üzerinde fonksiyonel bağlantısallık analizlerine yönelik pratik uygulamalar ele alınacaktır. MATLAB tabanlı CONN yazılımı kullanılarak, örnek bir veri seti üzerinden tohumdan voksele (seed-to-voxel) ve ilgi bölgeleri arası (ROI-to-ROI) bağlantısallık analizlerinin aşamaları gösterilecektir.
Kurs Planı: Kuramsal anlatım ve yöntemlerin bilgisayarda demonstrasyonu
Süre: Tam Gün
Yer: Başkent Üniversitesi Bağlıca Kampüsü ANKARA
Eğitimciler: Ali Bayram, Çiğdem Ulaşoğlu Yıldız, Elif Kurt, Gözde Kızılateş Evin
Saat | Fonksiyonel ve Yapısal Bağlantısallık Kursu |
---|---|
10:00 – 10:50 | Entrensek bağlantısallık ağları Eğitmen: Dr. Öğr. Üyesi Çiğdem Ulaşoğlu Yıldız • Entrensek bağlantısallık ağlarına giriş • Duysal-motor ve kognitif ağlar • Kognitif ağlar: Görev-pozitif ve görev-negatif ağlar • Entrensek bağlantısallık ağlarının yapısal bağlantıları • Kognitif perspektiften entrensek bağlantısallık ağları |
10:50 – 11:00 | Ara |
11:00 – 12:00 | Yapısal ve fonksiyonel bağlantısallık analizleri Eğitmen: Dr. Öğr. Üyesi Ali Bayram |
12:00 – 13:00 | Öğle Yemeği |
13:00 – 14:20 | Difüzyon ağırlıklı MRG verisinde yapısal bağlantısallık analizlerinin pratik uygulamaları Eğitmen: Dr. Gözde Kızılateş Evin • Difüzyon ağırlıklı MRG verisinin önişlenmesi ve tensörlerin hesaplanması • TBSS analizinin uygulanması • GLM oluşturulması ve gruplar arası karşılaştırmalar • Fsleyes yazılımı ile sonuçların görselleştirilmesi |
14:20 – 14:40 | Ara |
14:40 – 16:00 | Dinlenim durumu fMRG verisi üzerinde fonksiyonel bağlantısallık analizlerinin pratik uygulamaları Eğitmen: Öğr. Gör. Dr. Elif Kurt • CONN yazılımının tanıtımı • CONN arayüzünde veri girişi • Gürültü temizleme • 1. ve 2. seviye analiz basamaklarının anlatılması |